在袭击新普罗维登斯之后,美国海军只参加了一次较大的战役‐‐1779年的佩诺布斯科特远征。这次战役主要由马萨诸塞州海军遂行,目标是攻击在缅因卡斯廷的英国-托利党人基地,护送部队的舰船有16艘,另外还有美国海军与3艘船进行加强。这16船中火力最强的是有32门炮的快速帆船&ldo;华伦&rdo;号,船长达德利&iddot;索尔顿斯托尔指挥这次远征。7月后期到达卡斯廷后,这支组织不善的部队进展缓慢。英国援军赢得时间从纽约赶到。于是美国人不光彩地沿着佩诺布斯科特河逃命,将船撞到了岸上。
除新泽西和特拉华以外,所有的东部13州在战争中都建了州海军,但这些海军主要由小船组成,没有什么重大行动。
美国海军最杰出的成就就是将战火烧到了英国水域。美国海军为非中立的目的而使用法国基地有时也出现一些麻烦的事,因为法国人偶尔不得不对英国的抗议让步,但是结果还是使法国卷入了与英国的纷争。
进入欧洲水域的第一艘美国海军船是方帆双桅船&ldo;报复&rdo;号,由兰伯特&iddot;威克斯指挥。1776年底,本杰明&iddot;富兰克林坐这条船到达法国。1777年1月从南特出发,威克斯俘获了5条船。他把这些船带进法国港口引起了英国的抗议。独桅前后帆快船&ldo;海豚&rdo;号装备完毕加上美国海军的方帆双桅船&ldo;列克星敦&rdo;号到达法国构成了一个分舰队,威克斯带着它绕着爱尔兰转了一个月抓了18艘船。在秋天返回美国的途中,&ldo;海豚&rdo;号在纽芬兰大浅滩附近海域遇风暴沉没,船长一同遇难。
同时,美国在法机构买了斜桁横帆小船&ldo;突袭&rdo;号,戈斯塔瓦斯&iddot;康宁汉被任命为指挥。5月份从敦克尔刻出发,不久就俘获两艘船返回。英国的抗议导致法国政府交出了被俘船只,扣留了&ldo;突袭&rdo;号,把康宁汉及其船员关进了监狱。但富兰克林及时地救出了他,让他指挥独桅前后帆快船&ldo;复仇&rdo;号。从法国,继而从西班牙基地出外行动,他对于波旁王朝和英国之间的日益紧张的局势起了不小的作用。
如果霍普金斯由商船改成的分舰队是第一支美国海军的话,那么议会1775年底批准的13艘快速帆船就被认为是第二支。这些快速帆船不是由商船改造而成的,从龙骨起都是按真正的战舰建造的,但建一支由真正战舰组成的高效率舰队的诺言一直也没实现。13艘快速帆船中的6艘因为种种原因根本没有出海,而另外几艘中有4艘是短命的。特别好,特别快的&ldo;汉考克&rdo;号有32门炮,被一艘有44门炮的英国船缴获。在佩诺布斯科特湾,约翰&iddot;巴里船长面对强敌被迫撞滩,&ldo;罗利&rdo;号丢了。&ldo;华伦&rdo;号丢在佩诺布斯科特远征中。只有&ldo;兰道夫&rdo;号(装有32门炮)是光荣地沉没。它的船长尼古拉&iddot;比德尔曾在霍普金斯手下指挥过&ldo;安德鲁&iddot;多利亚&rdo;号,后来还进行过一次成功的巡航。在英国人于1777年初挺进费城时,他很幸运地把&ldo;兰道夫&rdo;号从特拉华河开到了海上。1778年春,比德尔受命由&ldo;兰道夫&rdo;号带领一支小分舰队穷追英国的巡航队。3月份在巴巴多斯附近他遇到了装有64门炮的&ldo;雅茅斯&rdo;号。比德尔向它发起攻击。在没有得到分舰队其它舰船支援的情况下,眼看就要胜利了,突然&ldo;兰道夫&rdo;号的弹药舱爆炸,使美国失去一位杰出的军官。
所以到1780年,只有3艘快速帆船可用,&ldo;波士顿&rdo;号和&ldo;普罗维登斯&rdo;号在一次向南巡航之后进入查尔斯顿,共同守卫这个城市。后来,在向英国人进攻时这两艘战舰全都损失了。&ldo;特兰伯尔&rdo;号独自生存到1781年,主要是因为在1780年之前它不能越过康涅狄格河而出海。
美国海军中最优秀的军官是约翰&iddot;保罗&iddot;琼斯。在霍普金斯手下,他担任过&ldo;艾尔弗雷德&rdo;号的上尉;他成功地指挥过&ldo;普罗维登斯&rdo;号和&ldo;艾尔弗雷德&rdo;号进行巡航。1777年他被任命指挥有18门炮的&ldo;兰杰&rdo;号,同年秋天驶去法国。当法美联盟条约签字的时候,他恰好在法国,在基伯龙湾愉快地接受了一支法国分舰队的致敬。1778年春,他带着&ldo;兰杰&rdo;号绕着爱尔兰向岸上袭击,抓获了有20门炮的&ldo;德雷克&rdo;号。一年以后,他受命指挥一艘东印度公司古老陈旧的商船&ldo;波恩霍姆&iddot;理查德&rdo;号。1779年8月,他登上这艘船,率领着一艘新的有32门炮的美国快速帆船&ldo;联盟&rdo;号(由办事鲁莽的法国籍船长比埃尔&iddot;朗代指挥)和3艘法国船组成的小分舰队绕着不列颠群岛顺时针转了一圈,抓获好几艘船。9月4日晚,在英国东海岸的弗兰伯勒角附近打了一次他最有名的战斗。
黄昏时分,当他偷偷接近一支英国船队时,遇到两艘护航船‐‐理查德&iddot;皮尔逊船长的有50门炮的新快速帆船&ldo;塞拉彼斯&rdo;号和有20门炮的&ldo;斯卡伯罗伯爵夫人&rdo;号。一艘法舰向&ldo;伯爵夫人&rdo;号进攻,琼斯带着&ldo;波恩霍姆&iddot;理查德&rdo;号进攻&ldo;塞拉彼斯&rdo;号。在舷炮的第一次交锋中,琼斯的2门最重的炮爆炸,炮组的其余部分也被损坏,&ldo;理查德&rdo;号的舷侧火力强度减至195磅,而&ldo;塞拉彼斯&rdo;号为300磅。